Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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