Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Upk1bQ9Z2C6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Upk1bQ9Z2C6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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