Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms