Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PapolbQ9WVP6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms