Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.6 ms