Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms