Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV86

Katna1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katna1Q9WV86 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Katna1Q9WV86 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Katna1Q9WV86 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Katna1Q9WV86 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Katna1Q9WV86 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Katna1Q9WV86 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Katna1Q9WV86 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Katna1Q9WV86 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Katna1Q9WV86 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Katna1Q9WV86 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Katna1Q9WV86 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Katna1Q9WV86 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Katna1Q9WV86 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Katna1Q9WV86 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Katna1Q9WV86 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Katna1Q9WV86 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Katna1Q9WV86 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Katna1Q9WV86 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms