Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms