Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms