Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms