Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S8

Capn7, Calpain-7, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn7Q9R1S8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn7Q9R1S8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms