Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ntn3Q9R1A3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms