Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nphs1Q9QZS7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms