Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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Col4a4Q9QZR9 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Col4a4Q9QZR9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Col4a4Q9QZR9 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Col4a4Q9QZR9 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Col4a4Q9QZR9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Col4a4Q9QZR9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Col4a4Q9QZR9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Col4a4Q9QZR9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Col4a4Q9QZR9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Col4a4Q9QZR9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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