Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ8

H2afy, Core histone macro-H2A.1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afyQ9QZQ8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms