Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms