Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Tnnt3Q9QZ47 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms