Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms