Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms