Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms