Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl2Q9QUK0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms