Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms