Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM61

Thsd1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd1Q9JM61 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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