Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms