Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AatfQ9JKX4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms