Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms