Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms