Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms