Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Nova1Q9JKN6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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Nova1Q9JKN6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms