Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms