Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ybx3Q9JKB3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms