Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJD0

Thap11, THAP domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thap11Q9JJD0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thap11Q9JJD0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Thap11Q9JJD0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thap11Q9JJD0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thap11Q9JJD0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thap11Q9JJD0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thap11Q9JJD0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thap11Q9JJD0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thap11Q9JJD0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thap11Q9JJD0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thap11Q9JJD0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thap11Q9JJD0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thap11Q9JJD0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Thap11Q9JJD0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thap11Q9JJD0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms