Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1fQ9JIS7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms