Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Cldn19Q9ET38 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
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Cldn19Q9ET38 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Cldn19Q9ET38 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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Cldn19Q9ET38 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Cldn19Q9ET38 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Cldn19Q9ET38 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Cldn19Q9ET38 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Cldn19Q9ET38 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Cldn19Q9ET38 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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