Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms