Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms