Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ms4a4bQ9ES61 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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