Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms