Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx12Q9ER00 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms