Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ7

Rims2, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims2Q9EQZ7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rims2Q9EQZ7 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rims2Q9EQZ7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rims2Q9EQZ7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rims2Q9EQZ7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rims2Q9EQZ7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rims2Q9EQZ7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rims2Q9EQZ7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rims2Q9EQZ7 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rims2Q9EQZ7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms