Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms