Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms