Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smco2Q9DA21 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smco2Q9DA21 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smco2Q9DA21 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smco2Q9DA21 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smco2Q9DA21 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smco2Q9DA21 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smco2Q9DA21 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smco2Q9DA21 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smco2Q9DA21 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Smco2Q9DA21 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Smco2Q9DA21 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smco2Q9DA21 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smco2Q9DA21 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smco2Q9DA21 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smco2Q9DA21 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smco2Q9DA21 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smco2Q9DA21 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smco2Q9DA21 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smco2Q9DA21 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smco2Q9DA21 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smco2Q9DA21 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smco2Q9DA21 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smco2Q9DA21 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smco2Q9DA21 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smco2Q9DA21 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smco2Q9DA21 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms