Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms