Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Y7

Tnfaip8l2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms