Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U0

Ifrd2, Interferon-related developmental regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd2Q9D8U0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms