Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms