Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Derl3Q9D8K3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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