Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms