Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119 ms